A képlet szerinti keresések a leggyorsabbak, valamivel gyorsabbak, mint a név szerintiek.
Minél több vegyületre vonatkozik a találat, a keresés annál lassúbb lesz. Ennélfogva a legspecifikusabb kereséssel kell indítani, majd fokozatosan bôvíteni. Szem elôtt tartandó, hogy az egyes keresések után nem kell fizetni, így a találat nélküli keresésnél sincs büntetés.
Nem érdemes olyan alszerkezet kereséseket indítani, mely nagy számú vegyületben elôfordulhat. Hattagú széngyûrûre vonatkozó keresés ebbe a kategóriába esne, és ezt tulajdonképpen a szerver visszautasítja. Alszerkezet kereséseknél meg kell próbálni annyira specifikusnak lenni, amennyire csak lehet. Az összes lehetôség közül a szerkezet szerinti keresés a leglassúbb, elôször is a SMILES jelsorozat ChemDraw formátumú szerkezetté történô átalakításának mintegy 15 másodperces idôigénye miatt.
Kerülni kell a nagyon általános kereséseket. Az összes olyan vegyületre történô keresés, melynek képlete tartalmaz "CH"-t, nagyon sokáig tart és igen érdektelen eredményre vezet.